小寂回到了真新镇，把武藏，小次郎，喵喵劝他们退出火箭队，喵喵归武藏。
挑战橘子联盟中，小寂被迫收下了一位抚养家的24枚神奇宝贝蛋，家里的所有的杰尼龟与妙蛙种子都进化为最终形态，幕下力士进化为超力王，并打败了首席训练师勇次。
挑战CD联盟中，渡给的神奇宝贝蛋孵化出来，是一只单首龙。
小寂打完白银联盟，被带到了一个实验室，那群将小寂带走的人原来是想要小寂的神奇宝贝，但被超梦给打跑了。
小寂还在实验室解救了一只沼王，一只大剑鬼，一只布里卡隆，一只喷火龙，一只大力鳄，一只大菊花，一只火爆兽，并成功收服。小寂还了解到，这是一个神秘集团--银河队的实验室。还在实验室外捡到了一个蛋。
在回真心镇的路上，遇到一位长者，小寂被长者打败后，长者让小寂将所有的初学者神奇宝贝最终形态留在这里，小寂想：你这么厉害，它们被你训练，就会更厉害。小寂便答应了。
小寂得知自己住在丰缘的的妹妹小乐也10岁了，小寂便寄了6枚蛋给小乐。
小寂回到真新镇后，得知自己有一个兄弟，叫沫萧锋，正在丰缘旅行。
小伍第二天，来到了小寂家中。小霞也来到了小寂家中，希望小寂带着她一起去丰缘。
小寂让龙辰爷爷把小伍和小霞的神奇宝贝携带数量变成无限。
小寂将超梦留在了家里，让超梦指导自己的神奇宝贝训练。
小寂带着小伍和小霞来到火箭队总部，得知小静前几天出逃，去了丰缘。
