此次巫妖大战前后蔓延十几年之久，终于在鸿钧地强势干预下，勉强落下帷幕了。巫妖两族损失惨重，千万大军，侥幸逃过灭顶之灾的，不过区区几十万人，好一个两败俱伤！
巫妖两族经过这次大战，均伤了元气，也真正了解了对方的实力，对对方首次出现的大阵，也吃惊不已，均觉得对方了得，难以取胜，也只好停战，但明眼人都看出来，这巫妖之间已经是不死不休的因果，如今只是暂时调停，一旦他们实力恢复了，早晚又有一战。
十二祖巫凝聚盘古真身，法力消耗太多，深受重伤，大巫更是损失不计其数。妖族也不好过，大妖损失尚且不计，就连两大高手都受到惨重打击。大阵被强行攻破，帝俊被反噬，河图洛书作为阵眼，受损极大，也是实力大损。东皇太一受那盘古真身的全力一击，虽然侥幸靠东皇钟的威力，终于挡住，但有苦自知，东皇钟受损颇大，短时间无法使用了，自身修为亦是大损。
在鸿钧的威势下，两族也就不再争斗，老老实实地各归天地，一边休养生息，一边享受那付出巨大代价换来的权利与地位去了。巫族先是在各地大修山神土地庙，派巫人出任，监管洪荒。妖族则是大封各路妖神为那周天大神，各自执掌有司。妖族得了那天庭重地尚且不足，眼看既然洪荒大地不能下手了，那就抢占水道。于是在各处河川大泽，大封河神河伯。同时点齐高手威那四海龙族，四海龙族自从洪荒三族大战后，实力大损，安于享乐久矣，不擅长与人争斗，被无奈只好俯首称臣，倒也弄得天庭一正神之位，从此行龙神之道，监管四海有名。
洪荒世界经过此次巫妖大战，除却生灵涂炭，环境却是受损不大，毕竟此时两族争斗，是为争那洪荒大地。任谁也不愿破坏那洪荒，毕竟如果抢到手的是一片废墟，任谁也不愿意，是以多以肉搏，毁天灭地的手段倒是极少使用。少了这些巫妖满天下的厮杀掠夺，洪荒生灵却是得到了一个良好的发展环境。
在天宫和巫族分管天地而治后，洪荒大地终于恢复了难得的平静……
此后多有那灵物得道或者来历不明者开始出现在洪荒大陆，行走游历，却是为了拜师之事。原来巫妖大战，普通人虽没有亲见，却也有所耳闻，那等惨烈场面，倒是吓坏了不少人心肝。
于是开始有人四处寻访名师，一是为那玄奥的修行法门。洪荒世界不同以后，众多修行法门还没出现，而那些大神的道法也没有以后外传的那么泛滥。很多人倒是靠本能修行，朝吞暮吐，采集天地灵气，洪荒灵气虽比不上开天初，但也充盈，法力增长倒也迅速，只是那道行却是不见长进，修大道，却不入道之门者，不知凡几。
二来倒是欲寻得一处好的庇护，免得大难来时遭了无妄之灾，若得高人庇佑，倒是可以安心参那天机大道，长诵黄庭。
巫妖大战对众神的影响却是更为深远，两族的强大破坏力，却是真个让大神都汗颜，众大神胆战心惊之下，倒都有了一番考虑。
五庄观率先向整个洪荒宣布，此后闭观不出，谢客千年。镇元子和红云这两个老好人倒是遁世更深了，从此打定主意，除去紫霄宫听讲外，坚决不出，好好参悟大道，不结因果，免得身殒化无。
其他几人倒是恰恰相反。先是老子下凡，路过那首阳山，见一人面山而跪，好奇之下一询问，却是一苦行拜师之人。此人倒也是灵物得道，一直苦寻明师，专往那名山大川跑，每至一处，也不管山中是否有明师，必定跪拜三月，三月无功后，再去下一处。老子修行之法，倒也讲究些无为，须得大恒心，大毅力者方能习得。乍遇此人，掐指一算，却是正与自己有那师徒之缘，而且其心智弥坚，倒是一璞玉。
老子随即收下他为徒，赐名玄都，也不再游历，径直回转昆仑山去了。
原始的做法倒与老子不同，他直接传话洪荒，凡是有缘之人，除去巫妖二族，皆可去昆仑山拜师。一时间群情激奋，不知其数的人冲往昆仑山。众人到了那昆仑山，却是不能悠然而入，与早前想象的所差甚远，原来那昆仑山却是布了一大幻阵，能过者，皆可为原始徒。最后一共十三人过了幻阵。原始倒也爽性立刻收了其中十二人为徒，尽皆赐了名，正是那日后阐教十二位金仙。最后单单留下其中之一人，却是一个面貌似慈善者。
此人名为燃灯，也在紫宵宫听过道。实力已至大罗金仙顶峰，快要突破至准圣，此时原始尚未成圣，心有顾忌，自是不会收一个与自己同辈之人为徒。
“敢问大仙为何不收小人为徒。”燃灯有些忿忿不平，自己也算中规中矩地过了那考验，怎的却不能拜师？
“你与我有师徒缘，却无师徒分，不过你终归过了那考验，不与你个交代，终是不好。”原始想了想，“你也就暂且为我门下记名弟子，也不用敬爱师门，随时亦可离去。”原始不想却因此埋下了祸根。
通天先去了一趟昆仑山，拜见一下老子原始，看到他们忙于收徒，他也不收门徒，老子原始看到通天没收徒，就劝说他也收些徒弟，通天就推辞说自己已有几个徒弟，且自己修为低下，尚要努力修炼，就不收徒了。其实通天看到老子原始收的徒弟都快笑掉大牙了，他们的资质连他的三代弟子都比不上，他根本就看不上，还亏得后来老子原始那么护短。通天敢肯定，鸿钧不出手的话，就凭自己的九个弟子，就能横扫洪荒了。同时也因为通天明面上的徒弟极少，导致后来三清没闹矛盾，也没有分家，并引发了一系列变化。
三人又谈论了一些自己领悟的大道，相互交流后，通天便告辞。
通天回蓬莱岛后，如往昔一般，除开坛讲道，便是闭关淬炼得来的巫族精血，将之提炼成盘古精血，完善自己的盘古真身。他现在不用修炼，他的体内混沌世界就可不断提升他的法力，完善他的盘古真身。他或到金鳌岛去管理一下岛上事务，闲暇时也在岛上讲道，旁听生越来越多，通天看岛上生灵太少，就布下一炼心大阵，整个大阵共有十八层，每经过一层都要通过一番考验，只有意志坚毅的人才会通过，而通过大阵的人就会受到金鳌岛大阵的保护，且有机会听他讲道，修那蓬莱大道。自此金鳌岛上的生灵也越来越多。
通天在指导完蓬莱岛内众人的修行后，忽然心中一动，默查之下，顿时大喜，随即瞬移消失在碧游宫之中。
下一刻通天已经来到了混沌珠的一个空间之中。只见一只巨大的笔傲然挺立在灰蒙蒙的混沌空间内，通体散发出苍凉、古朴的气息。一着青色长袍的青年独立在轮回笔前，孤傲的身影与身后的轮回笔交相辉映，长发飘然间目视远方。
“徒儿大功告成，可喜可贺！”通天的声音响起，那青年转身恭敬地道：“徒儿墨玄见过师父！”声音中充满了无尽的感伤，好似看尽一切的垂幕老者，与年轻的身形实在是相差的离谱。
“哈哈，徒儿终于看破世事，只历二世就成功出得春秋轮回笔，大出为师的意料！”通天高兴地说道。墨玄等人入春秋轮回笔至今已有二十年，外面十年，轮回笔中一世，墨玄历两世就从轮回笔中出来，却是难得的很。其实这也与之前墨玄跟随他入洪荒历练有关，在洪荒历练之时，墨玄从不谙世事到成熟，看尽了人生百态，世事无常，心境已经提高到很高的一个地步了，这才得以这么快就从轮回笔中出来。
“你的师弟师妹们怕是还有很长的一段时间才能出来，你刚突破到亚圣后期，且混沌灵气对你好处极多，你就先在这混沌珠内修炼，巩固境界。我先离开这里。”通天又瞬移回到碧游宫。
岁月匆匆，很快又是一万年过去了，此刻的蓬莱岛中，八弟子终于从轮回笔中出来，经历了无数世的轮回，众弟子的心境皆已提高，且修为大进。
