到了8月份，除了在法国境外的法军部队外，其他法军都纳入了总参谋部的管理之下，和总后勤部门的供应之下。军队后勤物资供应开始稳定好转，近卫师的退役制度开始向全法军推行，部分极端共和分子被清洗出军队。
而随着荷兰赔款的支付，比利时和莱茵左岸地区的并入，法国财政状况开始有所改善。
但是以路易十六的名义建立了临时执政府之后，各地保王党势力有所抬头，他们开始叫嚣要清算革命分子，一时间大有用白色恐怖代替********之势。
对此路易。查理开会告诫自己领导下的执政府内阁，一、不能支持保王党分子的主张，以免造成农民及支持共和的人民的恐慌，而反对执政府；二、而不能公开表示打击保王党的主张，让热月党人借打击保卫党分子的机会攻击路易十六的执政地位。要求富歇指挥警察秘密拘捕带头煽动群众者，不管是保王党还是共和派。此外劳动党领导的各地的国民自卫军严格监控各城市，阻止大规模流血事件，特别是巴黎。
1795年8月22日，新宪法通过了。立法权交个两院，500人院和元老院。行政权交给5人组成的督政府。恢复两级选举制度，对选举人的资产进行严格规定，中产阶级重新获得了地位。500人院负责创建和讨论法律，元老院负责批准或否决法律。
五人督政官地位平等，每人担任三个月的督政府会议主席，享有签署权和国玺。每年改选五分之一。
接着国民公会又通过保障原三分之二国民公会议员必定当选的果月法令。这令商业联盟、劳动党、保王党和其他派别的政党分子非常不满。在路易。查理的纵容下，保王党分子的煽动下。大批保王党人和流亡者来到圣日尔曼郊区，他们毫不掩饰的穿上了舒安党人的服饰。
国民公会深感不妙，就命令巴拉斯拉拢军队准备平叛。而富歇此时向路易。查理告密。最近这段时间，巴拉斯拼命拉拢拿破仑，而拿破仑也经常出入巴拉斯组织的沙龙，和巴拉斯的情妇约瑟夫。德。阿尔博内打的火热。路易。查理心想自己这段时间的确疏忽了，拿破仑大概是以为被自己遗忘了才被巴拉斯动摇了吧。
事已至此，路易。查理并没有立即约见拿破仑，而是下令近卫师收缴萨布龙军营的大炮，并下令近卫师做好应变准备。
拿破仑似乎不能在忍受无所事事的状态，接受了巴拉斯平叛指挥官的任命。他命令繆拉去萨布龙军营收集大炮，结果繆拉在萨布龙军营被早就严阵以待的近卫师官兵逮捕了。但拿破仑还是弄到了几门4磅炮。接受巴拉斯拉拢的近3000名军队和1500名从监狱中解放出来的吉伦特派分子组成的89年爱国者营，在国民公会附近的街道筑起了街垒。
10月4-5日深夜，近2万5千被保王党人煽动的群众包围了杜伊勒里宫，国民公会所在地。拿破仑果断命令自己的大炮对群众开火，但是他所收集的大炮数量过少，导致群众虽然损失惨重但尚未崩溃。
听到炮火声后，对事变一无所知的卡尔诺，在路易。查理的要求下，附签了戒严令。早有准备的路易。查理等人，即刻下令国民自卫军和近卫师出动，为了不让事态发展到无可挽回的地步，路易。查理严令不得使用新式大炮。
国民自卫军驱散了个区的起义群众，而围攻国民公会的群众被驱散后，守卫国民公会的军队还未松口气，近卫师已经重新包围了杜伊勒里宫，巴黎城防司令圣伯夫要求守卫国民公会的军队放下武器，立即投降。
一时之间，这些军队哗然了，部分89年爱国者营的士兵想要反抗，近卫师毫不留情的用大炮轰击了过去，拿破仑下令停止抵抗，要求面见路易。查理。圣伯夫准将冷冷的说道：“只要你放下武器，就能见到殿下。”
最后拿破仑终于决定打起白旗投降，放下武器的士兵被押送到城外的萨布龙军营，而拿破仑、布律纳、卡尔托、杜邦、卢瓦宋、瓦肖特、韦朱等军官们则下令被关进圣奥诺雷路上的修道院。
当近卫师肃清了国民公会内外的武装后，路易。查理带着一队士兵走进了国民公会。巴拉斯脸色苍白，塔里安坐立不安。谢尼埃站起来朝路易。查理咆哮道：“暴君，你是来摧毁共和国的吗？”
路易。查理制止了想要上前抓人的卫兵，说道：“这是我听过的最荒唐的控诉，下令向人民开枪的独裁者控诉制止屠杀的执政官。”
加蒙站了起来说道：“我们只是想要保卫宪法？”路易。查理嘲笑道：“就用向人民开炮来保卫吗？”
路易。查理站在了演讲台上，不顾下面议员的噪杂声，宣布：“现在我代表人民要求废止三分之二议员必定当选的附加法。”接着他下令每个议员一个个到演讲台前投票并说明理由。
在近卫师官兵的监视下，最后以489票对261票通过了废除三分之二议员必定当选的附加法。得到结果后路易。查理宣布国民公会就此结束，接下来进行两会的选举。
10月7日1795年宪法和国民议会解散的消息被刊登在法兰西日报上。路易。查理提心吊胆的准备应对共和分子和军队的反扑，不过三天过去了，并没有那个城市的三级会议反对，反倒是随着北部、东部城市三级议会的支持声后，南部、西部城市也都宣布接受。
10月20日，五百人院和元老院选举结束，在劳动党和商业联盟的严格操控下。五百人院属于劳动党和商业联盟的有384人，而元老院则占了三分之一弱的人数。
很快新的督政府五人执政官被选出来了，西哀耶斯、勒贝尔、路易十六、弗勒塞尔、费拉斯。但是西哀耶斯坚持拒绝这一任命，于是卡尔诺替代了他。
随后两院通过了立法，修改了督政府每年改选五分之一的条款，而是代以执政官五年任期。
督政府成立后路易。查理建议费拉斯领导波塔利斯、特龙谢、比戈·德·普雷阿梅讷和马尔维尔四位法学家组成的委员会起草《民法典》。
尘埃落定后，路易。查理宣布释放了所有被抓的群众、士兵、和军官。但是这些士兵和军官都被打发到地方部队或强制退役了。路易。查理亲自去修道院把拿破仑接了出来，拿破仑看上去憔悴不堪，见到路易。查理也是默默无语。
一路沉默后，马车停了下来。拿破仑看到马车外的豪宅时，终于涨红了脸说道：“亲爱的朋友，你是在羞辱我吗？”
路易。查理安静的看着拿破仑，直到拿破仑冷静下来后才说道：“朋友是不会羞辱朋友的，我只是想告诉你，你应该好好想想自己到底想要什么。下去吧，现在这所房子，和房子里的人都是属于你的了，如果你想好了，我相信你知道在那里能找到我。”拿破仑茫然的下了车子，站在曾经是巴拉斯的宅邸前，路易。查理随后就吩咐马车离开了。
离开没多远，一个人拦住了马车，走了上来。当他在路易。查理面前坐下后，随即问道：“殿下，需要监视他吗？”“富歇先生，有时候知道的太多未必是幸福，你觉得你这样的生活有乐趣吗？”“没有，但这让我感觉安全。”沉默许久之后，富歇在马车停下路易。查理下车的时候说道。路易。查理只是顿了顿就头也不回的离开了。
随后在基本掌握了全国的政权后，1795年11月路易。查理在两院发表了宣告和解的宣言：自今日始不论任何党派都不予以追究革命期间的任何失误，任何以革命期间的口号私自报复或挑起争端的均应受到流放海外殖民地的惩罚。同时成立国家平反委员会，对革命期间因为诬告、或无辜被牵连的人民可以提出平反，经过调查后发还私人财物，及取消罪名。流亡国外者名单不在增加名字。所有抗拒宣誓的教士，宣布效忠新宪法后即可回国，在不反对教会的地区传教。所有流亡贵族只有宣布效忠新宪法，则可发还其私人住宅、财产和一小块田地维持生活。对旺代、布列塔尼的叛军予以招安。
和解宣言发布后，很快法国零星的叛乱都平息下来了，路易。查理随后下令把法国分为5个军区，东部军区，西部军区，南部军区，巴黎军区，还有被法军占据的比利时、荷兰的莱茵军区。并要求各军区接受总参谋部的指挥。除了滨海军区外，其他军区都宣誓接受了总参谋部的领导。
路易。查理随后又把各地的国民自卫军全部改组成武装警察，负责各地的治安，打击区域内的土匪。这只警察部队接受警务部长和陆军部长的双重领导，但是武装警察总司令却是路易。查理亲自任命的。
1795年12月路易。查理改组全国驿站为法国邮政部，并把驿站的客栈脱离出来交给商业联盟成立连锁酒店。道路交通和信息传递开始急剧发展。1793年法国牧师沙普发明的信号塔，用编码通信和望远镜传递信息230公里只要两分钟。经过验证后开始在全法国兴建信号塔。同时路易。查理开始要求科学院对电流、电磁学的研究加大投入。
