一步跨进营房，杨树棠就冲盛世才发起牢骚：“盛总指挥，为保新疆安宁，我们舍生忘死追随你，南征北战，将士们立下赫赫战功。结果呢？让那些蹲在家里享清福的人得了好处，真是亏了好汉子，便宜了松汉子，冷手抓了热馒头，热手捡了个冷石头，这算啥世道吗？”“就是，我们都不服，我想盛总您也咽不下这口窝囊气。刘文龙何德何能？居然做了主席；郑润成何功之有？败军之将，还好有脸周武郑王地来做军事委员长？金树仁已把新疆治得乱麻其堂，他两个能收拾这种局面？鬼都不信。马仲英已进驻吐鲁番，指日打过天山来，谁能阻挡？只有您盛总指挥。”袁耀宗噼噼叭叭地释放出一腔怨气。盛世才听了心中暗喜，杨、袁二位所说，正是他盛某人几欲倾吐的心声，只是没有合适的场所。现在由他二人直肠子吃大豆，噼噼叭叭放出来，那是求之不得。尽管二位怨气大，言语直而冲，他却没有丝毫责怪之意，并且乘机启发说：“临出门，刘主席和郑委员长说，下午重新讨论军事督办制问题。你们有看法，完全可以在会上提嘛。”
杨、袁二团长听了心领神会，立马琢磨起提意见的事来。参加“四、一二”政变第一次会议的要员们，应约在省党部出席了第二次会议，时间间隔不足两天！盛世才在杨、袁二位团长陪同下，最后进入会场。省府要员们在虎视眈眈的卫士“保护”下开会，无不提心吊胆，偶一仰头，又见庭院四周的屋顶架上了几挺机关枪，更是噤若寒蝉，相形之下，比在归化军控制下召开的第一次会议，更为恐怖，那归化军只不过得意忘形于一时，张牙舞爪而已。
刘文龙终于琢磨透了盛世才临行撂下的那几句话，不照盛的意思办，肯定过不了铁门关。照盛的意思办，对自己只有好处，没有坏处。于是，首先提议增选盛世才、张培元及一些畏兀儿、回、蒙古、哈萨克、锡伯等民族的知名人士为临时省府委员，并推举陶明樾为临时省府秘书长。
接着重新讨论省府军事领导机构及其人选问题。刘文龙违心地做了盛世才的传声筒，重唱了盛世才强调新疆情况特殊，需恢复军事督办制的调子。巴品古特见风驶舵，也赞成恢复军事督办制，撤销政变当夜组建的军事委员会制，并提议选盛世才为临时督办。
盛世才表面知若罔闻，心里感激莫名，巴品古特，你转得真快！谢谢你首议之情。
郑润成从会场气氛已觉察到会议的风向和结局，听了刘文龙和巴品古特的发言，更是心明眼亮，当即表态：“诸位同仁，郑某不才，昔日抗日不敌，无功而抵新疆暂居，日后仍要回东北前线去。前日众人推不才就军事委员会委员长之职，真有沐猴而冠之嫌。莫说三军将士不服，郑某也于心难安。为确保新疆治安，郑某决不做那个委员长。也同意废去军事委员长制，恢复督办制。”
杨树棠乘机接上发言：“杨某虽不是什么政府要员，但是几次剿匪的前线军人，有几句话憋了许久，今天不能不讲。众所周知，杨将军治下的新疆是个什么样子？世道太平，百姓安居乐业。在中央不给拨款的情况下，能做到财政收支持平，是非常不简单的。当然，也有不足不是之处，今天不谈这个。可‘七、七’事变之后，金树仁主政的这五年，又是个什么样子呢？战乱频频，民不聊生。尤其这三年，我们年年、月月、日日在打仗，都打烦了，死了多少人？耗费了多少财力物力？这样的日子不能继续下去啦！眼下马仲英二进新疆，已驻进吐鲁番，指日进攻迪化。有他的老部下马世明、马全禄、马德祥的有力内应，新疆他是志在必得。”杨树棠走着说着，猛一回首，说：“在这种危机四伏的情形下，除了盛总指挥，你们谁能担挡重任？这可不能打肿脸来充胖子。”“是呀，一个和加尼牙孜，一个尧乐娃子，外加一个马仲英，先前谁胜过？刘希曾、鲁效祖、杜国治、黎海如一个个败下阵来，损兵折将，惨得无言形容。谁胜过？张培元胜过一回，调走了；盛总指挥一连胜了好多回，这是不争的事实，不是我们这些部下胡吹冒料。如今马仲英卷土重来，已经是大兵压境，重新开战迫在眉睫，谁能担当此任？谁能保卫省府？谁能保障百姓生命财产安全？请问，你们这二十几个要员中，有谁？请站起来，叫我们认识认识。”袁耀宗兜着圈子巡视着说叨了一通。
杨、袁二位的插话咄咄逼人，摆的尽是人人皆知的事实，与会者无可反驳，左挑右选，还确实找不出比盛世才更合适的人来担当非常时期的边防督办。
要员们面面相觑，无奈何，没有更合适的人选；无奈何，盛世才气焰熏天，只得纷纷附和。盛世才终于凭实力如愿以偿地继任了新疆边防督办，做了省军最高长官一一三军统帅。
盛世才既已做了督办，掌管新疆一切军事军务，那剩下的棘手问题，自然非他处置不可，首当其冲的是：解决驻守红山的金树仁。如何处置？招抚，不可能，从“四、一二”后，金树仁不惜血本，不遗余力地反政变，由此可以断定；消灭，于心不忍，毕竟是金树仁聘用了自己，虽曾屈受撤职处分，但不久仍委以重任，以至有东山再起的今日。再说了，人人皆知他盛世才来新不久，是金树仁提拔重用了他，并委以总指挥之军事要职，掌控千军万马。若处死金树仁，虽能根除复辟之后患，但却要落下一个中山狼的恶名，不足以服众，今后如何挺起腰板做人，如何训导下属恪尽职守，效忠上峰？盛世才一时陷入左右为难之中。
盛世才正在琢磨明智可行的办法，忽然炮兵营长出现在眼前，请示何时开炮，一切准备就绪。盛世才突然眼睛一亮，有了，命令道：“炮要打得猛，打得密集，打得准，但不能命中住房和工事，不能伤及金树仁，要让他知道，红山是守不住的。明白吗？只造声势，不许死人。”
“明白。”炮兵营长领命而去。金树仁眼见自己购置的大炮轰炸自个，不禁流下哀伤凄惋的泪水，顿觉大势已去，主席、督办算什么？而且本来就是别人的，是自己运气好，赶了个巧。这大炮一响，证明盛世才投入政变一方，反政变已毫无指望。何况马仲英今非昔比，昔日区区几百号人闹得天翻地覆，而今成了正规国民军，他要进新疆，有谁能拦得住？五千大军且不说，就那躲在山沟沟里的三匹马，就很难收拾。唉！江山代有才人出，由他去吧，还是保全身家性命要紧，归去来兮！
金树仁撤离的决心一下，由杨正中部保护，沿昌吉、景化、绥来一路西逃而去。他深知所过之地，均不太平，便决定奔好老乡好部下张培元而去。
金树仁执政期间，与苏联关系尚可。“四、一二”政变之后，苏联领事馆非常关注局势的发展。斟酌比对再三，盛世才尚是个未知数，不如支持金树仁。领事馆得知金树仁出逃信息后，马上派人追赶，一直追到绥来，才见到了神情沮丧的金树仁。苏领事馆人员当即表示，他们可以帮金树仁反政变，直到成功。
不料，金树仁却慨当以慷地掷出一句“借外力以自重，吾不为也。”
毫不犹豫毫不留恋地调头西去，一直退到乌苏，电请伊犁屯垦使张培元增援，反攻迪化。结果，张培元不但拒不发兵，而且不允许金树仁去伊犁，仍在记恨撤销其东路剿匪总指挥之职。金树仁直到现在，才心灰意冷，完全断绝了复辟自救的念头。张培元堵了伊犁，他可走塔城，这一条退路，他曾事先预想过，万一哪天被推倒，不能落个走投无路的下场，故而极其宽宏大度，把败军之帅鲁效祖安排到塔城做了专员，现时派上了用场。鲁效祖也不乏感恩之心，闻讯远道欢迎，金树仁绝路逢生。
金树仁总算有了喘息之机，一面给国民党中央致电辞职，一面写信给张培元，希望他收编其护卫部众。金树仁稍事休息，便转道苏联，回天津去。
盛世才见金树仁知趣地一路西去，也就不赶尽杀绝，集中精力着手解决最棘手的难题，如何稳妥有效地对付马仲英，保住从政变中得到的丰硕果实。
同时，他也不敢小觑铁杆保皇派，那杨正中仍滞留在乌苏一带，并掌控一部分军队，不可掉以轻心。最让他放心不下的是归化军，他们既已归化，却又很不安分，竟充当了政变的急先锋，不用他盛某人出手，金树仁便灰溜溜地在归化军的枪炮声中逃之夭夭了。虽然自己赶巧做了渔翁，但终究是一块心病，这些人是苏联的叛逆者，今天他们可以助陶明樾推翻金树仁，谁敢担保他们明日不拆我盛某人的台？弄得好，他们可以为我所用；弄不好，既是威胁新疆稳定的因素，又是破坏对苏关系的危险分子，他们若把新疆变成反苏的国外基地，那问题就严重啦！
那么，如何才能有效地掌控这支战斗力挺强的部队呢？
盛世才思来想去，惟有强化省军，因为省军才是新疆军队的根本。只有建成一支强大的省军，方能有效地制约归化军。为此，盛世才一炮轰走金树仁后，便迫不及待地整编部队。他将新疆边防军整编为混合旅，下设四个骑兵团和一个警卫团，自兼旅长；将东北军整编为四个步兵旅，全部配给武器；归化军编制不动，仍有巴品古特统领。
整编部队的同时，盛世才绞尽脑汁考虑如何对待发动和参与政变的人。这些人虽不是政变的支柱，但他们的活动能量不可低估，虽然他们并不掌控军队，但他们可以通过各种渠道利用军队。若不是他们策划发动政变，金树仁一时半会儿还倒不了，这边防督办的宝座不会如此之快如此顺当地落在盛某手里。这种社会现象，怎么说呢？叫它借力打力，怕是再恰当不过吧。如果不给他们应当的位子，既不能服众，也不能抚慰冒死参加政变的人。可是，奖励的职位高了，他们从此手握重权，将会得寸进尺，得陇望蜀，而这高位仅有两个。对了，他们无权无势时可以发动“四、一二”政变，那有职有权了呢？就不可搞个“五、一二”“六、一二”政变？这种人的权力欲永无满足的时候，拿欲壑难平形容他们，再贴切不过。总之，不给他们好处不行，给多了也不行，反正得时时刻刻提防着点。
盛世才基于如上考虑，他拟出名单，由刘文龙召集大会讨论。这样一可遏制刘文龙独揽政权的优势，削弱他的决策权，二可将自己参与进去，扮演督办无所不问的角色。经讨论决定：张馨任省府委员、教育厅长；陶明樾任省府委员、省府秘书长；赵德寿任外交署长；李笑天任航空处处长；陈中任督办行营参谋长。
盛世才为了巩固新政权，他必须稳住遗老宿旧。夺得督办职位的第二天，他就与刘文龙商定，发急电给国民党中央，先汇报政变后的新疆局势稳定，新政权已有序地开展工作；后上报新的省政府和边防督办公署的组成人员，对遗老宿旧照原职上报待批。盛世才还夜以继日地把亲信安插到各要害部门，并责成公安局长派专人监视陶明樾等政变要人的行踪和动态，以多个小心达到多个安心。
