于是，诸葛长民的奴婢佣人们发现，自从老爷大富大贵后不久，就得了一种怪病：他常常半夜三更睡得好好的时候，突然一个标准的鲤鱼打挺从床上跳下来，然后拳打脚踢，好像是在和什么人搏斗，又像是在武力拒捕，吓得没人敢近前。曹操曾经声称梦中好杀人，但那是假的；诸葛长民梦中好打人，却是真的，而且这样的情况越来越频繁，一个月就要发生十几次。
用不着去看专家门诊，相信大家也看出来了，诸葛长民已经患上了严重的梦游症。著名现代心理分析学创始人弗洛伊德认为，梦游是一种潜意识压抑的情绪在适当时机发作的表现，因此，严重的梦游症患者往往有着巨大的心理压力，有些难为人道的痛苦经历。具体落实到诸葛长民身上，他为何而痛苦？答案其实是显而易见的。不过，痛苦归痛苦，煎熬归煎熬，诸葛长民此前还有一个重要的心理寄托能够说服自己：不用担心，前途是光明的！我毕竟是反桓起义的功臣啊！那些人怎么能和我比？再反腐应该也反不到我头上。
可是现在刘毅死了！功劳比自己大，地位比自己高的刘毅死了！不管他原先立了多大的功勋，都不能阻止诛杀的降临！这个事实无情地粉碎了诸葛长民长期赖以生存的心理防线：既然刘裕能够剿灭刘毅，那么当然也可以轻易铲除自己！刺骨的凉意透过脊背，让诸葛长民体会到了深深的不安，不由得对左右心腹叹息说：“前年醢彭越，今年杀韩信，大祸恐怕就要轮到我了（醢，hǎi，原意指肉酱，后引申为一种死刑，即把人剁成肉酱）！”
既然大祸将至，那么现在该怎么办？历史已经提供了一个现成的答案：西汉初年的淮南王英布在见到彭越、韩信相继丧命之后，采取的对策是起兵造反！就像他骁勇好斗的弟弟诸葛黎民说的那样：“当年的英布和彭越并不是同党，但大势所致，谁也不能单独幸免。刘毅被诛杀，足以成为我们的前车之鉴！应该趁现在刘裕还没有回来的机会起兵夺取中央大权。”然而，诸葛长民原本就算不上胸怀大志之人，又在富贵温柔乡里浸得太久，早已把原先那点儿机警果敢泡成了棉花糖。刘裕岂是好对付的？同他对着干，多半讨不了好去。而且刀既然还没架到脖子上，那就还有安享荣华的可能性，他实在提不起勇气下造反的决心。
因此，诸葛长民尽管很准确地预测到了自己的未来，但他在内心深处却千方百计地想否认这个未来。思来想去，他想出了一个掩耳盗铃的好主意来安慰自己。诸葛长民来找刘穆之，向他打听说：“现在听外边的人议论纷纷，都说刘太尉（即刘裕，义熙七年三月被加授太尉一职）非常猜忌怀疑我，事情真有这么严重吗？”刘穆之是干什么的，自然回答得天衣无缝：“外人的谣言也能信吗？刘公此次西征荆州，把老母妻子都交给您来照顾，如果对您稍有怀疑，怎么可能这么做？”
就像一位癌症晚期患者刚刚注射了杜冷丁，身体的不适暂时消失了，诸葛长民获得了他渴望得到的假想安全感，满意地回去了。但一回到自己的府第，诸葛黎民就一个劲地怂恿他造反：“刘穆之说的话也能信？难道你不记得了，上次刘裕西征卢循时，留守建康，照顾刘裕家小的人是谁？”诸葛长民当然记得，那个人是刘毅。诸葛长民并不是傻瓜，并没有天真到相信刘穆之说的话，但他的内心里实在很想相信刘穆之，可这种无奈，又能说与谁听？诸葛黎民毫不留情地揭开了他最不愿意相信的事实，刚刚赶走的烦恼和苦闷在外边兜了个圈，又都回来找到了组织。诸葛长民踌躇良久，叹息说：“当年贫贱的时候，只想着博取富贵。等富贵真正到手，却与危难相随。如今就是想放手，重新做个京口布衣也不可能了！”
【是祸躲不过】
但总不能什么都不做吧？患得患失的诸葛长民寻思来寻思去，终于下了一步蠢棋，他给北青州刺史刘敬宣写了一封意义含糊的信：“盘龙（刘毅的小名）一向凶狠专断，目中无人，这次纯粹是自取灭亡。如今反叛分子都已经铲除干净，金光大道正向我们敞开，富贵荣华，我们应该一起去争取！”
尽管话说得遮遮掩掩，但刘敬宣还是清晰地闻出了诸葛长民想拉他上贼船的企图。刘敬宣与刘裕早就是至交好友，刘裕对他又屡有大恩，那种过命的交情，远非一般同僚诸葛长民可比。何况对刘裕的本事，刘敬宣早就佩服得五体投地。要和别人结盟反对刘裕？这种事刘敬宣不但不愿想，也不敢想（不知诸葛长民是什么眼光，竟然会选择拉拢刘敬宣）。因此他很明确地拒绝了诸葛长民的引诱，回信说：“下官自从义熙年间南归以来，先后历任三州、七郡，常常感到所得的福气已经过多，只怕自己的功德承受不起，将来反而遭祸。天天考虑的都是如何避盈居损，谦让处下，至于谋取更大的富贵，那不是我敢想的事。”
不仅如此，刘敬宣还将诸葛长民的亲笔信遣人送往荆州，交给刘裕。刘裕看信之后笑道：“我就知道，阿寿（刘敬宣的小名）是不会辜负我的！”差不多与此同时，刘穆之与亲信何承天商议了目前京城的局势后，也派人送信给刘裕，提醒他诸葛长民有异动，最好不要像平常那样按正常程序返回建康，以防止诸葛长民铤而走险，派人行刺！这便是前文提到的那两封信了。刘裕想，不错，刘穆之和刘敬宣果然是我的人，没有辜负自己的信任。那么，对那个已经辜负了自己的人，还有必要继续包容吗？
毫无疑问，不管能力，还是实力，诸葛长民都远远不是刘裕的对手，只要刘裕下决心摆平他，就绝无失败的可能。但就像今天的老美在用武力打击不顺眼的中小国家时一样，当打赢已不是问题的时候，要考虑的就是如何实现零伤亡了。诸葛长民如果真发动叛乱，虽然肯定会被自己打败，但那样一来，自己的家小，一班将领们的亲属，还有刘穆之等人都会有危险，而且刚刚恢复安定的建康城也可能再遭破坏，这些都是应该极力避免的。而避免这一切的发生就要尽量不刺激诸葛长民，因为他只要还能苟安，就会选择苟安。
因此，刘裕在荆州一待三个月，迟迟不回去。曾劝刘裕不可让刘毅带兵讨卢循的王诞向刘裕请求先回建康。刘裕对他说：“诸葛长民已经起了作乱的心思，你现在回去不怕有危险吗？”王诞回答：“长民知道我一向受刘公的信赖，如今刘公让我一个人轻身回去，正好显示刘公对他并无怀疑，他就不会轻易造反了。”刘裕笑道：“你的勇气超过孟贲、夏育了（孟贲、夏育是战国时有名的大力士，古人很喜欢将两人并称，当做勇士的代名词）！”于是就让王诞先回建康。果然，诸葛长民见王诞毫无防备地回来，认为事情还有转机，更加下不了反叛的决心了。
刘裕终于宣布要回建康了，并公布了回去的日程表。眼看刘裕公布的日期到了，诸葛长民不敢怠慢，率领留守建康的文武百官前往新亭迎接。谁知一等就是一整天，一直不见刘裕船队的影子，直到临近傍晚，才有人来通知说：“众位大人不用等了，刘公有事耽搁了，明天才到。”所有人只好回去。第二天，诸葛长民和各位大臣又在新亭等候，奈何结局和第一天相同，刘裕又有事，归期又推迟了！第三天、第四天，仿佛没有创意的肥皂剧，相同的情节一再上演。就算放羊的顽童喊“狼来了”都没这么夸张，更惨的是，当刘裕喊“狼来了”的时候，你还不能不作为。众大臣们虽然不乐意，但又不敢不去，只是在心里犯嘀咕：刘太尉该不是有意耍我们吧？
鲁达在镇关西肉铺里的回答可以代表刘裕的心声：“就是来戏耍你的！”义熙九年（公元413年）二月三十日夜，刘裕突然乘坐着一条不起眼的小船到达建康，在猛士丁旿等数名亲信的陪同下秘密回到太尉府，除刘穆之等极少数亲信外，建康城中几乎无人知晓。
第二天一早，诸葛长民原本还打算再去新亭熬时间，突然接到刘裕已经回到京城的通知，不由得大吃一惊。仓促间他已经不可能再做出别的反应，只好硬起头皮，前往太尉府拜见刘裕。
出乎诸葛长民的意料，刘裕的表情格外和蔼，完全看不到暴风雨来临前密布的乌云。难道真是自己多心了？刘裕根本没有要对付自己的意思？一会儿，刘裕将诸葛长民请进内室，命所有侍从都出去，只留下他们两个人同床对坐，叙谈旧日情谊。刘裕说得很动情，他的一生已经历了如此多的惊心动魄，如此多的九死一生，站在人上人的巅峰，回顾崎岖的攀登之路，其中有多少是不能说的隐秘？又有多少是不足为外人道的伤痛？在这个时候，刘裕全都毫无隐晦地向诸葛长民和盘托出，仿佛对面坐着的人并不是不久前还谋划反叛的异己分子，而是失散多年的生死至交，在历尽艰险死里逃生之后又再度相遇。
诸葛长民又惊又喜，恍惚间似乎时光又回到了当年一同歃血结盟，密谋反桓的岁月，对面坐的仍是慷慨仗义的刘大哥。那一刻，他几乎被感动得热泪盈眶，已无暇仔细思量刘裕为什么会对他说那些话。一时冲动下，他估计连今后要洗心革面，永远追随刘大哥的念头都有了。
就在诸葛长民心潮澎湃，对外界的感知变得麻木的时刻，可能刘裕做了什么暗号，藏在屏风背后的心腹卫士丁旿突然冲了出来，一把将诸葛长民从床上拉下，掷于地上，然后一连几拳，将其殴毙于床侧。刘裕仍然平静地坐着，默默看着诸葛长民一命呜呼，脸上带着未完全退去的笑意……
很难弄清楚刘裕为何要用这么戏剧性的方式杀死诸葛长民，因为大可不必。没有任何史书记载过诸葛长民有什么过人的勇力，即使玩单挑，也九成不会是曾以一敌千的刘裕对手，何况屋内又有一个忠勇堪比典韦、许褚的丁旿？更不用说众多护卫。其实当诸葛长民踏进太尉府的那一刻起，刘裕已经可以不费吹灰之力地置其于死地，根本用不着这么多废话，那么刘裕为何还要这么做呢？也许，其中并没有多少厚黑的成分，仅仅是因为刘裕需要倾诉。
现代心理学认为，人是需要宣泄情绪的，如果把所有事都埋藏在心底，是一种难言的痛苦。生活在这个世界上并不容易，各种各样不如意的应激事件都会使人的心理产生焦虑，这种焦虑如果得不到及时疏导，就会以一种心理能量的形式积聚下来，当这种积聚到达某个临界点的时候，就会使人患上抑郁症甚至精神分裂。而最好的应对手段就是倾诉，将内心的感受对另一个人诉说，让痛苦释放出去，心灵就会得到解放，获得轻松。
刘裕此生的经历比普通人何止复杂百倍？他虽然已经干下了惊天动地的伟业，但我们也不能忘记：他仍然是一个凡人，也有喜怒哀乐，也会在危险来临时紧张，也会在敌人挑衅时愤怒，也会在战友反目时感慨，也会在亲朋过世时伤痛。但他的身份又迫使他必须将这一切隐藏起来，根据需要而不是根据心情，去戴上精神面具。可想而知，那个深藏在面具之下的真实的刘裕是多么需要倾诉自己的心声。
然而，这个世界上又有很多事，是不能让别人知道的。我们现在也就可以大致明白了：刘裕为什么向诸葛长民倾诉自己的隐秘，不去找与他真正关系亲密的刘穆之或刘敬宣，不是因为他把诸葛长民当成自己人，也不是故意要迷惑诸葛长民，让其没有防备，而是因为诸葛长民马上要死了，谁还能比死人更会保守秘密？
诸葛长民死后，尸体被拖到廷尉府（相当于今天的最高法院），廷尉府的官员们以很高的效率完成了案件的审理工作，证明诸葛长民罪大恶极，现已被依法处决，随后派人捕杀他的兄弟同党。诸葛黎民不甘心束手就擒，挥刀与前来抓捕的士兵搏斗至死，幼弟大司马参军诸葛幼民、堂弟宁朔将军诸葛秀之均被处死，诸葛长民的家族被彻底清除。
尽管从法律程序上说，诸葛长民完全是被非法处死的，对他的事后审理绝无半点司法公正可言，但与被刘裕清洗的其他政敌相比，他在当时获得的同情最少。曾经被他管辖过的官民百姓，在得知大贪官诸葛长民已经全族被杀的消息后，无不拍手称快。一句讥讽他的民谣开始在建康一带传扬：“做官的可不要飞扬跋扈，无法无天，否则丁旿会来收拾你们！（勿跋扈，付丁旿）”人生在世，还是应该多做点善事，少做点坏事的。所以，归根结底诸葛长民的祸还是自己惹下的。至此，当年一同密谋反桓的十二个首领，除刘裕外，只剩一个像老黄牛般不争名利、任劳任怨的王仲德还活在人世。
【朱龄石伐蜀】
就在刘裕清除诸葛长民一族时，朱龄石率领的征蜀部队在沿着长江三峡缓缓西进，因为是逆流，水道险恶，速度非常慢，直到义熙九年（公元413年）六月才抵达白帝城。
按原来的安排，朱龄石打开了刘裕授予的锦囊，密令的主要内容如下：主力沿外水而上取成都，让臧熹率一支偏师沿中水西上取广汉，再拨出最大的战船十余艘，让老弱士兵驾驭着，沿内水而上作为疑兵。
要理解这个计划有何高明之处，先得弄明白几个名词：内水、中水、外水。简单来说，四川盆地的地形是西北高东南低，长江沿盆地南沿向东流，有几条较大的江河由北向南穿过盆地注入长江。由于在古代，水运的效率远远超过陆输，这几条江河就顺理成章地成为古代巴蜀地区的交通要道。当时的人由东向西将这几条江河分别取名为内水（今天的嘉陵江至涪江）、中水（今天的沱江）和外水（今天的岷江）。
其实关于这个作战计划的具体内容，朱龄石并非此时方知，早在出兵前，刘裕就与他对此进行过探讨。当时两人商议之后认为，上一次刘敬宣伐蜀就是取道内水，受阻于黄虎，结果无功而返。按一般常规，既然上次内水走不通，那么这次就会改走外水、中水。但谯蜀估计会认为刘裕用兵出人意料，办事不按常规，极可能仍走内水，他们自以为能看穿刘裕的用兵方法，会仍以重兵防守内水，若晋军出黄虎，正好又落入他们的算计。所以这次偏偏要按常规办事，以主力沿外水取成都，直捣其老巢；以疑兵出内水，让他们以为自己判断正确；以偏师出中水，插入成都与驻防内水的蜀军主力之间，牵制蜀军回援成都的道路。
听起来很玄吧？这是一个否定加否定等于肯定的计划，很像《三国演义》中的桥段：
曹操即将在赤壁战败时，诸葛亮命关羽前往华容道设伏，阻截败退的曹军，特地吩咐关羽在华容道点燃烟火，引曹操前来。果然曹操败退，要回江陵，有葫芦口和华容道两条路可走，他让探哨侦察一下两条路的动静，结果葫芦口看起来一切正常，而华容道似有狼烟。众谋士认为，既然华容道有狼烟，多半有埋伏，应该走葫芦口。结果老曹一口否决，他说：“周瑜和诸葛亮都是狡猾的人，一定知道兵法上虚则实之、实则虚之的道理，所以肯定是有意派人在华容道放烟，引我走葫芦口，我偏不上当！”
结果，《三国演义》中的曹操上当了，谯纵也上当了。
