第二日一早，李九成率领一万军兵出城列队。叛军这一亮相，反倒把明军搞糊涂了，按道理说，他们连战连败，应该龟缩在城中不出才对。
祖大弼却不管许多，以两千关宁铁骑为箭头，将五千军马列出迎敌。
两边军队同时冲锋，战争进程与首战一样，祖家家将祖宽率领的关宁铁骑如入无人之境，纵横冲突，叛军无人能撄其锋。
却见居于后列的李九成并不慌乱，他将令旗挥摆，指挥前军撤退。当明军追到登州城下时，城头耿仲明立即下令开火，顿时登州城头大炮齐鸣，火铳、火箭一通狂发，这下子连明军带叛军一块打，战场硝烟弥漫，士兵们一片片的倒下，侥幸生还的士兵被大炮震的晕头转向，不知所以。
祖大弼与祖宽见势不妙，率领军队撤退，突然，大炮声戛然而止，李九成率领叛军潮涌般，又杀了出来，这次却是掩杀明军，明军后退中自相残踏，死伤不少。
吴三桂和席铭见战场上明军不利，急领各自部队前往接应。席铭正指挥军兵冲锋，忽见远处叛军中一员将领，头戴银盔，身着钢甲，手中擎着一面小旗，正是刚才指挥叛军撤退复又冲锋的首领。
席铭眼疾手快，立即摘下强弓，扣上箭矢，略一瞄准，箭矢已划破长空，径向那将领而去。远处那将领还在指挥叛军掩杀明军，那箭已破空而至，直插入咽喉，他哼也没哼就倒在地上。
席铭未想到的是，被射中的将领正是叛军主将之一的李九成，此人在吴桥煽动孔有德叛乱，又多次出谋划策，在山东大地掀起腥风血雨，今日终在席铭箭下伏法。
李九成一死，叛军顿时陷入一片混乱，城头的耿仲明一看情况不妙，连忙号令退兵，担当接应任务的孔有德，刚刚杀出城门，眼见李九成被人射死当地，赶紧退回城池，城外叛军们也纷纷逃跑，由于城头火炮实在太猛，明军不敢轻易靠近，只得眼睁睁目送叛军逃入登州。
孔有德的首要谋士李九成身亡，其它将领如耿仲明、李应元虽然勇悍，但都拿不出退兵良策，因此叛军从此紧闭城门，不再出城列队。而登州的城防既坚，火炮又猛，明军也不敢轻易靠近，双方就此进入僵持阶段。
又过了三个月，登州城中的孔有德坐不住了，叛军的粮草基本耗尽，再坚持下去，恐怕只有饿死在城内，他又想起了曾经屡次不爽的老把戏：接受招安。可是这一招同样行不通，明军这次是坚定信心除恶务尽了。
这一日，孔有德又召集耿仲明、李应元、毛承禄等人开会，大家此时情绪极其低落，孔有德再三询问，铁杆心腹耿仲明言道：“大元帅，目前的形势，只有一条路可以选择。”
孔有德心知肚明是哪一条路，还是问道：“你说说看？”
耿仲明道：“不如便弃城而走，在外面四处游荡，总比困死在这要好。”
孔有德皱眉道：“可如今大军围城，我们如何能走的脱呢？”
耿仲明道：“目前登州城内还有两万士卒，而围城明军不过三万人马，他们分在三面城门布防，兵力难免分散，我军集中火力从一个城门冲出，兵力可居优势。一旦突出重围，进入山东南部，那可就是鱼入大海，鸟飞高天了。”
毛承禄问道：“耿将军，我们为何不从海上走呢？”他是当年皮岛守将左都督毛文龙的养子，被孔有德引诱反叛，目前也是叛军主将之一。
耿仲明道：“从海上走，只能投奔后金，如今我们乃败军之将，对方是否愿意接收还是两说，哪有自己单干来的快活。”
众人不再答话，都默认了耿仲明的意见，孔有德开始部署突围具体步骤，经过一番缜密计议，拟定如下作战计划：集中兵力从西门突围，以三千骑兵为先锋，率先冲锋，五千步兵紧跟在后，孔有德、耿仲明、李应元各带一路人马，分三路进行突围。
末了，孔有德下令：城中主将及家眷即刻开始收拾财物，毕竟他们祸乱山东数月，积累了大量不义之财，这些财物是一定要带走的，可是他没想到，这确是一步臭棋。
城中有人开始收拾财物，这种事如何掩人耳目，顿时谣言四处流传。一个叛军下级军官见势不妙，连夜逃出城外，向明军报告了孔有德即将突围的情报。
金国奇、吴襄与朱大典一商量，干脆将计就计，叛军分三路突围，就布置三路伏兵，分别进行阻击。
这是一举攻破叛军的大好机会，众将纷纷请令，祖大弼、刘泽清、吴三桂、刘良佐等都要求参与伏击，山东巡抚朱大典一看此情形，心想：辽东兵果然好战，每战都要抢功。
众位将军纷纷请令之时，席铭却没动，待得思虑成熟之后，他站前一步朗声道：“金总兵、吴将军、朱巡抚，属下想进一言。”吴襄现在是带罪立功，暂无总兵头衔，因此席铭称呼他为吴将军。
旁边祖大弼一听，心道：得儿，又来一个抢功的。
金国奇对席铭很是客气：“席将军，但说无妨。”
席铭朗声道：“虽说叛军此次突围是从陆路而走，但海上路线也不得不防。叛军突围之时，防守一定松懈，我率领所部攻击登州水城，截断叛军从水路逃走路线。如此可瓮中捉鳖矣。”他熟知此段历史，知道孔有德最终是从海上逃跑，此后投降后金，为祸中原。
金国奇觉得有理，与吴襄、朱大典一合计，最终决定由祖大弼、吴三桂、刘泽清各带五千人马分别伏击三支突围的叛军队伍，由席铭率领三千人马乘乱攻击登州水城。
席铭领受任务之后，心想：这水城是登州防御海上进攻的屏障，同样坚固无比，该如何攻破呢？
思虑再三，终于想出一条计策，他命令赵泉率领三百工兵，趁夜在水城下挖地道，将地道一直挖到城墙之下，然后在地道中埋设大量火药。
孔有德果然兵分三路，开始突围，没想到刚出西门不久便被明军伏击，祖大弼、吴三桂、刘泽清截住三路叛军，一通砍杀。孔有德心知突围失败，赶紧往回逃窜，城上叛军也开炮策应，城外叛军这才侥幸逃回登州城。
与此同时，攻击水城的战斗也已打响。席铭清楚必须以迅雷般的速度拿下水城，截断海逃之路。他命令赵泉引爆火药，只听一声巨响，硝烟弥漫，水城城墙被炸塌一半。
凌鹏、栾雄、赵泉各带五百人马从豁口处往里冲。由于此处是叛军最后一个逃跑出口，孔有德在这里布置了严密防守，虽说突围行动对叛军军心造成极大影响，但部分叛军依旧奋勇抵抗，使用火箭和火铳进行死守，战斗进行的异常惨烈。
此时，已有军兵报告孔有德，一支凶悍的明军部队，正猛冲水城，水城城墙塌陷，恐无力坚守。孔有德明白现在已到最后时刻，必须立下决断。他立即命令叛军主将和家属携带财物登船出海。
登州城是明朝重要军港，海面停泊大量船只。孔有德一面派人增援水城，一面带领数千叛军紧急从水路登船。
此时席铭的先头部队已经进入水城，栾雄率军冲在最前，却发现数只巨大的舰船已准备开拔，他立即派人报告席铭。
席铭赶到时，舰船已经启动。
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